标签: Bioinfo

关于基因ID的知识记录

之前没注意这方面的知识,后来有次要作图,KEGG和GO的图,才发现基因ID的问题,记录如下。

myVCF对突变文件进行可视化分析

最近在做突变分析,偶然看到有myVCF这个小工具,但是搜到的资料实在有限,自己摸索了摸索,将安装及使用过程总结一下。

GATK4实现寻找SNP记录

GATK4这个工具我真的想疯狂吐槽一下,不断更新确实是好事,但是官网上关于同一个tool的各种manual以及Q&A给出的例子都不一致,简直抓狂,记录下自己的实践情况吧,非常辛酸。
2019.10.15:本记录中使用的是GATK4.1.2.0,不完全适用于最新版本的GATK4。
2021.12.03:教程更新为GATK4.2.3.0,增加hg38相关
2022.7.13:GATK官网持续改版,部分链接失效,更新链接